El interior del Hospital de mujeres se organiza en torno a dos patios comunicantes decorados con azulejos holandeses, entre los que hay una escalera. En el primero de ellos destacan los arcos de medio punto y pilastras. Asimismo, entre el patio y la fachada se encuentra la Capilla de Nuestra Sra. Del Carmen, una iglesia de salón dividida en tres naves por columnas dóricas de mármol. Es de gran interés en este espacio su colección de retablos. 

Entre las obras de arte de la capilla, destaca el cuadro de La Visión de San Francisco con el Compañero de Espalda, de aproximadamente 1601, de El Greco. Se trata, sin duda, de otro de los lugares de interés de la ciudad.